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    Awesome Digital Tools for Citizen Science

    Digital Tools for Citizen Scienceを扱う資料や関連プロジェクトをまとめたAwesomeリストです。

    目次

    ソフトウェア

    実験機器ソフトウェア

    • Grafana - 実験データを可視化するダッシュボード（オンラインで作成することも可能）を作成する
    • mMass - 質量分析計のためのオープンソースソフトウェア
    • Stellarium - 天体観測用のオープンソースプラネタリウムソフトウェア

    モデリングと計算

    • OpenSCAD - 3Dモデリングソフトウェア
    • SageMath - クラウドベースのオープンソース計算環境（MATLABやMathematicaに類似）
    • GNU Octave - MATLABに類する無料の数値計算ソフトウェア
    • Dia - 図の作成に使えるオープンソースソフトウェア
    • Gephi - オープングラフ可視化プラットフォーム
    • QGIS - オープンソースGISソフトウェア
    • Mineways - Minecraftのモデルファイルを3D印刷用の.stlファイルに変換するツール
    • ALOHA - 米国環境保護庁（EPA）が提供する、化学漏れや爆発危険領域をモデル化するソフトウェア
    • vegan - コミュニティ生態学における統計処理に使うRパッケージ
    • BOINC - オープンソースで、ボランティアや市民科学者のコンピュータを科学研究プロジェクトに接続するクロスプラットフォームのボランティアコンピューティングネットワーク。CERNや世界中の大学で使用されている。
    • YData Profiling - 一般用途のオープンソースデータプロファイラー。データセットの高レベル分析に特化。
    • Desbordante - データ内の複雑なパターンの発見と検証に特化したオープンソースデータプロファイラー。

    出版、共同作業、組織運営

    • Zotero - オープンソースの文献管理ソフトウェア
    • TiddlyWiki - 情報を整理するための自作Wikiを簡単に作成できる
    • Evergreen ILS - 書籍の図書館を管理（貸出プロセスを含む）するソフトウェア
    • ISLE - NASA が開発したオープンソースの実験室設備在庫管理システム
    • GanttProject - タスクのスケジュールやGanttチャートを作成するための生産性ツール
    • Open Science Framework - 科学研究用のオープンソース協働プロジェクト管理ソフトウェア
    • Calibre - eBookを管理するソフトウェア
    • LibraryThing - 図書館を整理するためのオンラインプラットフォーム。
    • PECE - 実験的かつ協働的なエチノグラフィーのためのプラットフォーム。このプロジェクトは、学術的な協働を支援するオンラインプラットフォームを提供しており、複雑な信用の明確化を助けます。これは人間学の専門家向けですが、今後、より広範な分野に拡大されます。
    • RapidPro - SMSを介してユーザーが相互作用できるようにする、スケーラブルなアプリケーションを構築できるオープンソースプラットフォーム。
    • eu-citizen.science - 200プロジェクトへのリンク
    • Zooniverse - 動物園および宇宙プロジェクトのウェブサイト
    • Yourself to Science - 市民がデータ、生物サンプル、あるいは自らの体を研究に寄与できる機会を示すオープンソースカタログ。

    Graphs and Visualization

    • GraphViz - 科学的なグラフを作成するためのツール

    教育

    • Light and Matter - ベンジャミン・クロールの無料ダウンロード・低価格購入可能なオープンソース物理学教科書。
    • OpenStax - 多くの基本的な分野（例：物理学、数学など）のオープンライセンスおよび協働編集された教科書のリポジトリ。電子書籍としてダウンロード可能または印刷コピーを注文できます。
    • PhET Simulations - コロラド大学ボルダー校のインタラクティブな物理学および化学シミュレーション。
    • United Diversity Co-op Library - パーキュラチャー、農業、経済、工作、活動主義など、さまざまなテーマについての興味深い教科書やその他のリソースをPDF形式で収録した大規模な図書館。
    • Microbe Wiki - マイクロバイオロジーに関する、多くの大学が参加する学生が編集したウィキ。
    • OpenCulture Textbooks - 情報のオープン共有を目的としたウェブサイトの教科書セクション。
    • Free Tech Books - 無料の電子書籍（主にコンピュータサイエンスおよび工学）。
    • OpenWetWare - バイオラボプロトコルのリストを維持し、チーム使用の電子ノートを提供するサイト。

    ツールと機器

    生物学と化学

    • The ODIN - 安価なDIYバイオリサーチ機器を販売するディストリビューター。
    • Bento Box - Bento Labの低コストPCRワークステーション。
    • OpenTrons - 液体操作用のオープンソースロボット。
    • OpenPCR - PCR用のオープンソース熱サイクル装置。
    • SGD - スタンフォード大学のサッカローム・ゲノムデータベース。
    • BLAST - 局所一致検索ツール
    • IORodeo - 安価なオープンソース電位計、色度計、その他機器の販売
    • BioSurplus - 使われたバイオラボ機器の販売業者
    • DremelFuge - ドリームルのアタッチメントのように構成されたバイオ分離回転機
    • Paperfuge - 回転玩具のメカニズムを参考にした、超低コストかつ手動で動く回転機
    • Ministat - DIY化学反応装置
    • MinION - 手頃な価格で持ち運び可能なDNA／RNAシーケンサ
    • SpikerBox - DIY神経科学用バイオアンプ

    環境科学と地質学

    • Raspberry Shake - ラズベリーピーと互換可能な地震計
    • Smoky Mountain Scientific - 環境モニタリング用のモジュール化・低コスト・オープンソースインストルメンテーション
    • AWEsome - 手頃な価格の空気中風力発電プロトタイプ

    GIS と地図作成

    • IMGtoKMZ - 地図タグ付き画像の大量をKMZファイルに変換するシンプルなツール（1枚の写真1つのマーカー）

    3D プリントと製作

    • Printables - 3D印刷可能なモデルデータベース（コンテストと活発なコミュニティあり）
    • Thingiverse - 3D印刷可能なモデルを検索できるエンジン
    • Ember - Autodeskを活用した、包括的にオープンソースのDLP SLA 3Dプリンタプロジェクト
    • 3D Printable Science Equipment - さまざまな3D印刷可能な科学道具とモデルのリスト
    • Precious Plastic - 自作3Dプリンタフィラメントの製作

    電子工作

    • C.H.I.P - 9ドルのLinuxコンピュータ
    • Raspberry Pi Zero - 最も安価で小型のラズベリーピー（5ドル）
    • Particle Electron - 自作デバイスをセルラーネットワークに接続するラズベリーピー類のマイクロコントローラ
    • SparkFun - DIYプロジェクト用のさまざまな電子機器を販売している企業、センサーを含む.
    • Red Pitaya - オシロスコープ、スペクトルアナライザー、信号発生器など、複数の信号処理機能を備えたオープンソースツール.
    • Podo - 貼り付け可能な高解像度Bluetoothカメラ.

    その他

    出版と研究の実践

    • Citizen Science: Theory and Practice - 市民科学における手法についての議論を目的としたオープンアクセス・ペアレーブリーディングジャーナル.
    • Scholar Subreddit - 科学論文にアクセスするための支援を求めるための素晴らしい場所（有料壁を越えた論文も含む）.
    • Library Genesis - 通常は有料壁を越えた論文にアクセスできるオンラインツール.
    • SciHub - 通常は有料壁を越えた科学論文にアクセスできる別のサイト.
    • Public Library of Science (PLOS) - 科学におけるオープンアクセスと透明性を推進する非営利組織.
    • arXiv - コロンビア大学が支援する、科学論文（主に物理学・数学）の初期版を共有・議論できるサイト.
    • Directory of Open Access Journals - 9000以上のジャーナルがリストアップされている.
    • Investigative Dashboard - 研究者、特にジャーナリストにとって、ドキュメントや成果を共有できるツール.
    • Taskade - 協働型のアウトライン、ノート、タスクマネージャー.

    文献

    市民科学の理論

    市民科学の実践

    市民科学の拠点とプロジェクト

    遺伝学／バイオハッキング

    • Genspace - ニューヨーク州ブロoklynにある、最も古く、最も成功したDIYバイオラボの一つ。
    • BioCurious - 世界で初めてのバイオハッキングスペース、カリフォルニア州スニーバルに位置する
    • HiveBio - シアトルのコミュニティバイオラボ。
    • SynthTechBio Network - ラテンアメリカのバイオハッカーのネットワーク。
    • Four Thieves Vinegar Collective - DIY薬品ハッキングプロジェクトを進めているグループ。たとえば、600ドルのエピペンの30ドルの代替品。

    環境

    • The Community Science Initiative - ニューヨーク州イタカにある非営利の水検査および環境データ機関。
    • Sanctuary for Weedy Species - ブロoklynにある都市生態プロジェクト。
    • Coweeta Listening Project - 南アパルト州の生態学的研究と市民活動を組み合わせたプロジェクト。
    • The Radix Center - アルバニー、ニューヨーク州におけるコミュニティベースの都市持続可能性／農業教育センター。
    • The Bucket Brigade - ラウリエ州ノルコに拠点を置く市民科学グループで、環境正義を訴えている。
    • Safecast - グローバルな放射能データを収集・可視化するオンラインの市民科学プロジェクト。
    • Rainforest Connection - プロジェクト：古いスマートフォンをセンサーとして活用し、違法伐採を防ぐ。

    その他

    • The Citizen Science Lab - ペンシルベニア州ピータルトに所在するコミュニティ科学ラボ
    • BioBus - 携帯型の科学教育ラボ。
    • Hillsboro Library of Things - オレゴン州ヒルズボロに本社を置く物理的な物体向けのライブラリ。科学および技術用の備品を含む。
    • Fab Foundation - デジタルファブリケーションのネットワーク「Fab Labs」を支援する組織
    • Farm Hack - オープンな農業ツールの製造プロジェクト

    アートと科学の拠点

    Community-driven science labs tend to operate differently from conventional labs. Their member-led and curiosity-driven approach often produces work that breaks down conventional disciplines, such as bio-art. This section is for listing spaces that may or may not be conventional makerspaces but capture this spirit of interdisciplinarity.

    • Coalesce: Center for Biological Arts - SUNYバッファローにあるバイオアートスタジオ・ラボ
    • MIT Media Lab - マサチューセッツ工科大学（MIT）に属する芸術・科学・技術の相互研究センター
    • Interspecifics - メキシコシティに拠点を置くアートと科学の交差点に取り組む集団。特に生物によって生成された音に関するプロジェクト
    • Center for Science and the Imagination - アリゾナ州立大学における芸術家と科学者の協働プロジェクト
    • STEM to STEAM - ロードアイランド工芸大学が推進する、STEM教育に芸術とデザインをより導入する取り組み
    • The Waag Society - オランダに拠点を置く協働型芸術・科学・技術の研究機関

    資金と支援

    資金源

    • Experiment.com - 科学分野のクラウドファンディングプラットフォーム
    • The Awesome Foundation - マイクログレート（1000ドル）を用いて、素晴らしいプロジェクトを支援する非営利団体
    • Endeavorist - 科学と技術に関する「好奇心のネットワーク」。ソーシャルネットワークとクラウドファンディングを組み合わせたもの
    • Herb Society of America - 小規模で非機関的な研究プロジェクトに適合する補助金を提供するもの
    • Seeding Labs - 開発途上国における研究室の設備と資金を提供するもの
    • EPA Environmental Education Grants - 小規模コミュニティ団体向けの補助金を提供するもの

    その他の支援

    会議とイベント

    • Innovative Citizen - ドイツのルーラー地域で開催される年次市民科学フェスティバル。有機製造、バイオハッキング、移動型農業、都市生態系における持続可能性に焦点を当てる。
    • iGEM - 多くのDIYバイオ実験室と連携する学生向け合成生物学コンテスト
    • Biofabricate - デザインに焦点を当てた年次カンファレンス。バイオテクノロジーに関連するデザイン、素材、技術に特化。
    • Biodesign Challenge - 学生向けデザインコンテスト。バイオテクノロジーの将来の応用を展望するものに集中。

    その他の資料

    • MOST - ミシガン工科大学のペアス研究グループによるオープン・サステナビリティ・テクノロジー。
    • OSGeo - Open Source Geospatial Foundation（OSGeo）は、GIS データを扱う多数のオープンツールを提供。
    • Open source engineering software - Appropediaに維持されている大きなリスト。
    • The Open Source Hardware Association - オープンハードウェアに関するすべてのリソース。設計や法的配慮を含む。
    • Biocanvas - 生物画像を芸術として収集したコレクション。
    • The Powercube - コミュニティ運営者による、権力の理解と行動の促進に関する文献およびワークショップ。
    • Detroit Future City: A Field Guide to Working with Lots - デトロイトの都市農業に関するガイド。

    疑問と知識の不足

    • 研究倫理は、多くの場合、連邦機関や機関内審査委員会（IRB）が監督します。これに代わる、市民主導のボトムアップな仕組みはあるでしょうか？

    このリストへの貢献方法

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    ライセンス

    著作権を主張する意図はありません。

    CC0

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